토와, 세츠나, 모로하는 요괴와 인간의 피를 이어받은 반요 소녀들이다. 어린 시절에, 숲의 화재에 휘말리며 쌍둥이인 토와와 세츠나는 헤어진다. 언니인 토와는 시공을 뛰어넘는 시대수의 터널을 통해 전국 시대에서 현대로 타임 슬립하여, 가영이의 본가에서 자라면서 무도에 뛰어난 중학생으로 성장했다. 한편 전국 시대에 남겨진 세츠나는 요괴퇴치사의 우두머리가 된 코하쿠 밑에서 요괴퇴치를 하고, 가영과 이누야사의 딸인 모로하도 역시 요괴 퇴치에 여념이 없다. 토와와 세츠나가 헤어진 지 10년. 시공을 뛰어넘는 시대수의 터널이 다시 열린다. 토와는 현대에 나타난 세츠나와 재회하지만, 어찌된 일인지 세츠나는 토와를 잊어버렸다. 세츠나와 함께 현대로 건너온 모로하까지 가세하면서 ‘반요 야샤히메’가 현대를, 그리고 전국 시대를 종횡무진 누비고 다닌다.